Le bâtiment se compose de trois volumes principaux : l'église, le couvent et la chapelle qui sera rendue au culte en cours de chantier. La volonté a été de lier les parties conservées aux nouveaux aménagements par le biais d'éléments contemporains créant des articulations franches qui sont l'occasion d'adapter les espaces initiaux du culte aux nouvelles nécessités du lieu.

L'accès au bâtiment se fait par un édicule plus bas, situé entre le volume de l'église et celui du couvent.
Une grande verrière couvre l'espace central du couvent et permet à l'ensemble des bureaux de bénéficier d'une lumière zénithale.
Outre la lumière, ce sont également les perspectives sur l'ancienne église, contrastant avec la structure métallique de la verrière horizontale, qui créent le caractère de l'atrium.
L'absence d'allège et la faible retombée de poutre dans les bureaux privilégient la transparence et le rapport à l'extérieur. La création d'un faux plancher généralisé, intégrant toutes les techniques, a permis de prolonger le vitrage jusqu'au sol.
Le noyau principal des circulations est tourné sur l'espace baigné de lumière et créant la liaison entre le couvent et l'église.
Le caractère monumental du volume de l'église, ses anciennes voûtes et ses arcs boutant restent très présents. La nouvelle structure faite de colonnes et de poutres métalliques se détache des anciens piliers en maçonnerie.

Le couvent abrite aujourd'hui la direction générale de l'administration et de la culture de la Commission Européenne. L'église a été aménagée pour accueillir la bibliothèque centrale de la C.E.E. (en partie supérieure) et le centre de visite du public européen (au rez-de-chaussée).